Подходы к анализу событий альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты человека
Альтернативный сплайсинг мРНК - ключевой этап посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, который обеспечивает экспрессию различных изоформ РНК. Этот механизм играет важную роль в развитии и функционировании плаценты. В качестве объекта исследования выбраны децидуальные клетки, которые име...
| Published in: | Вестник Томского государственного университета. Биология № 69. С. 48-57 |
|---|---|
| Other Authors: | , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/koha:001154762 Перейти в каталог НБ ТГУ |
| LEADER | 05164nab a2200409 c 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | koha001154762 | ||
| 005 | 20250408121615.0 | ||
| 007 | cr | | ||
| 008 | 250402|2025 ru s c rus d | ||
| 024 | 7 | |a 10.17223/19988591/69/6 |2 doi | |
| 035 | |a koha001154762 | ||
| 040 | |a RU-ToGU |b rus |c RU-ToGU | ||
| 245 | 1 | 0 | |a Подходы к анализу событий альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты человека |c М. М. Гавриленко, Е. А. Трифонова, А. А. Бабовская [и др.] |
| 246 | 1 | 1 | |a Approaches to the analysis of alternative splicing events in human placental decidual cells |
| 336 | |a Текст | ||
| 337 | |a электронный | ||
| 504 | |a Библиогр.: 12 назв. | ||
| 520 | 3 | |a Альтернативный сплайсинг мРНК - ключевой этап посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, который обеспечивает экспрессию различных изоформ РНК. Этот механизм играет важную роль в развитии и функционировании плаценты. В качестве объекта исследования выбраны децидуальные клетки, которые имеют ключевую роль как в поддержании физиологической беременности, так и в развитии акушерских осложнений. В исследовании проведено глубокое РНК секвенирование с детальным анализом событий альтернативного сплайсинга в плацентарной ткани при физиологическом течении беременности. Для анализа аннотированных классических событий альтернативного сплайсинга использованы программы MAJIQ, rMATS, SGSeq. В децидуальных клетках идентифицировано с помощью программы MAJIQ 3 501 аннотированное бинарное событие АС для 2 7 31 генов; с помощью программы rMATS - 66 687 событий для 14 784 генов; с помощью программы SGSeq - 15 782 события для 5 616 генов. Идентифицировано 15 887 экспрессирующихся в плаценте и подверженных альтернативному сплайсингу, из которых 1 857 генов являются общими по результатам трех различных программ. Анализ реконструированной генной сети позволил выявить регуляторные связи, обеспечивающие координированную экспрессию большинства центральных генов, которые ассоциированы с иммунной системой, клеточной миграцией, межклеточными контактами и регуляцией экспрессии. Полученные результаты подтверждают важность альтернативного сплайсинга, который существенно увеличивает транскрипционное разнообразие и представляет собой значимый механизм регуляции генов в децидуальных клетках. | |
| 653 | |a альтернативный сплайсинг | ||
| 653 | |a полнотранскриптомное секвенирование | ||
| 653 | |a плацента | ||
| 653 | |a децидуальные клетки | ||
| 655 | 4 | |a статьи в журналах | |
| 700 | 1 | |a Гавриленко, Мария Михайловна |9 431692 | |
| 700 | 1 | |a Трифонова, Екатерина Александровна |c кандидат медицинских наук |9 987666 | |
| 700 | 1 | |a Бабовская, Анастасия Александровна |9 987667 | |
| 700 | 1 | |a Зарубин, Алексей Андреевич |9 809897 | |
| 700 | 1 | |a Сваровская, Мария Геннадьевна |9 987668 | |
| 700 | 1 | |a Ижойкина, Екатерина Владимировна |9 987669 | |
| 700 | 1 | |a Степанов, Вадим Анатольевич |9 64419 | |
| 773 | 0 | |t Вестник Томского государственного университета. Биология |d 2025 |g № 69. С. 48-57 |x 1998-8591 |w 0210-37860 | |
| 852 | 4 | |a RU-ToGU | |
| 856 | 4 | |u https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/koha:001154762 | |
| 856 | |y Перейти в каталог НБ ТГУ |u https://koha.lib.tsu.ru/cgi-bin/koha/opac-detail.pl?biblionumber=1154762 | ||
| 908 | |a статья | ||
| 039 | |b 100 | ||
| 999 | |c 1154762 |d 1154762 | ||